26.08.2016.
Пласман у наредну рунду обезбедиће по две најбоље екипе из сваке групе, а нова сезона Лиге Европе стартује 15. септембра.

А група: Манчестер Јунајтед, Фенербахче, Фејнорд, Зорија.

Б група: Олимпијакос, АПОЕЛ, Јанг Бојс, Астана.

Ц група: Андерлехт, Сент Етјен, Мајнц, Габала.

Д група: Зенит, АЗ Алкмар, Макаби Тел Авив, Дандалк.

Е група: Викторија Плзен, Рома, Аустрија Беч, Астра Ђурђу.

Ф група: Атхлетик Билбао, Генк, Рапид Беч, Сасуоло.

Г група: Ајакс, Стандард Лијеж, Селта, Панатинаикос.

Х група: Шахтјор, Брага, Гент, Коњаспор.

И група: Шалке, Салцбург, Краснодар, Ница.

Ј група: Фиорентина, ПАОК, Либерец, Карабаг.

К група: Интер, Спарта Праг, Саутемптон, Хапоел Бер Шева.

Л група: Виљарреал, Стеауа, Цирих, Османлиспор.